扎鲁特旗有着悠久的历史渊源和深厚的文化底蕴。早在原始社会新石器时代，就有人类在这片土地上繁衍生息，至今保留有“红山文化”和“富河文化”历史遗存。据专家考证，商、周至秦朝时期这里属于东胡人的牧场;汉晋时期为乌桓、鲜卑人的住地；南北朝、隋、唐时期为奚、契丹人的住地；元代属于上都路;明嘉靖三十九年，内喀尔喀五部征服乌梁海泰宁卫之后，扎鲁特部开始驻牧在这片绿色的草原上。清顺治五年，扎鲁特部被正式确立为行政旗。